根据《关于将铁路运输和邮政业纳入营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2013〕106号）规定，单位以承包、承租、挂靠方式经营的，承包人、承租人、挂靠人（以下称承包人）以发包人、出租人、被挂靠人（以下称发包人）名义对外经营并由发包人承担相关法律责任的，以该发包人为纳税人。否则，以承包人为纳税人。

由于公司收取挂靠单位的管理费用，并同时开具运输发票，因此，公司属于交通运输业的纳税人。

天扬税务小助手提示：建筑业挂靠行为如果比照上述政策，那么被挂靠单位是增值税的纳税义务人，即有资质的单位是纳税义务人。